函授大专和自考大专主要是在入学方式，学习形式和毕业难度等方面存在不同，但是文凭效力是相同的，都是国家承认的正规文凭，所以考生可以根据函授和自考各自的优缺点以及自身实际情况选择最适合自己的方式学习。
1、入学方式
函授大专考生需要参加成人高考全国统一入学考试，被高校录取后方可入学。自考没有入学考试，且自考报考不受性别，年龄，种族以及学历等条件的限制，均可参加自学考试。
2、学习形式
函授是成人高考的一种学习形式，主要特点是以自学为主，面授为辅。而自考大专主要靠考生自己自学，对考生的自制力和自学能力都有一定的要求。
3、毕业难度
函授大专通过入学考试之后，毕业难度不大，只要参加每学期的考试，修满学分就能正常申请毕业了。而自考虽然没有入学考试，但是需要考生一门一门考过所有科目合格后才能申请毕业，自考的科目一般都有十几门，所以毕业难度较大。
